Saken gjelder det faktum at Microsoft "pakker" nettleseren Internet Explorer sammen med operativsystemet Windows, som selskapet tjener store penger på.
Tilbyr betaversjon av Windows 7
Mot fritt valg
Det undergraver konkurranseforholdene, og er et brudd på europeiske antitrustlover, mener EU.
– Det undergraver også arbeidet med utvikling av nye produkter. På lang sikt reduserer det forbrukernes frie valg, heter det i en uttalelse fra kommisjonen.
Uttalelsen kom fredag.
Saken har sin bakgrunn i en klage fra norske Opera. Opera mener Microsoft misbruker sin dominerende posisjon for å skaffe seg fordeler selskapet ellers ikke ville fått.
Kvalt
Opera er naturlig nok tilfreds med EUs avgjørelse.
– På vegne av alle Internett-brukere er vi glade for at EU-kommisjonen tar skritt i retning av å gjenopprette reell konkurranse i et marked som Microsoft har kvalt i mer enn et tiår, sier Opera-sjef Jon S. von Tetzchner, i en pressemelding.
Microsoft har fått åtte uker på seg til å svare på anklagene.
Selskapet har tidligere fått skarp kritikk for å knytte medieavspilleren Windows Media Player til operativsystemet Windows.