Heinonen har ledet granskningen av Irans atomprogram de siste fem årene.
Uten etterfølger
– Sjefinspektøren forlater det Wien-baserte byrået ved utgangen av august, forteller IAEAs talsperson Gull Tudor.
En arvtaker er ikke utnevnt foreløpig.
Tilsyn
Den finske atomeksperten ble utpekt av den tidligere sjefinspektøren Mohamed ElBaradei som ble etterfulgt av Yukiya Amano i fjor.
Selv før Heinonen ble overhodet for IAEA, holdt han tilsyn med inspeksjonene i Iran fra 2003 og 2005 når byrået avslørte landets hemmelige atomprogram.